一，时间回到2023年，此时男主上初中，女主上高中。在彗星坠落的前一天三叶来东京寻找泷，但此时对于男主来说不知道未来会在2023年与女主发生交换，故男主并不认识女主，女主伤心欲绝，将发结交予了男主。第二天，彗星陨落，女主“死亡“
2，三年后，即2023年，男主已经上了高中，才与女主发生了身体交换（女主也上高中，所以女主比男主大三岁)。男主从报纸上看到村庄消失和女主在死亡名单上，决定拯救女主。故男主喝了口嚼酒后回到了2023年彗星陨落的当天，而这一天，男女主发生了最后一次身体交换，也就是说，拯救村庄的其实是交换过身体后的女主，女主和村庄得救。因此，2023年死去的“女主“并没有死去，从这天之后，男女主也开始忘记对方。故事又回到2023年开始发展，但是是从2023年发生过彗星陨落后开始发展，此时女主上高中（后面也提到，村民在彗星陨落当天正好在演习，故村庄得救)，男主上初中，二者已经忘记彼此，就这样，男女主8年后重新相遇，故事结束。所以，女主一直比男主大三岁。
为什会出现男女主只在黄昏才能看到彼此？那是因为2023年的男主和2023年的女主不在同一个时空，只能在黄昏这个特殊的时间段才能看到彼此。
黄昏时，男主对女主说，发结我已经带了三年，现在还给你，这与结尾2023彗星陨落前一天来到东京看男主的女主将发结送予还在上初中的男主相呼应。

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刚刚看完你的名字，哭成狗。给你讲下结局吧。
彗星落下之后，泷跟三叶不再交换身体。泷开始寻找三叶，发现跟自己交换身体的三叶是三年前的三叶，而三叶在三年前的彗星事件中已死。但是泷不相信，于是去了在交换身体期间与外婆一起去过的神体的地方，喝下了三叶的口嚼酒，起身的时候摔倒，手机光线照耀下看到了神体壁绘上的彗星并且再次与三年前彗星到来前的三叶交换身体。
这里是一个转折，也就是改变历史了。
交换身体后，因为是泷的灵魂的三叶知道彗星会毁灭小镇，于是跟好友一起发动了拯救计划（过程略过），当然大家都不相信，于是泷认为如果是真正的三叶就能说服自己的父亲让大家避难，这是还是泷的灵魂的三叶前往神体寻找真正的三叶，在黄昏时分（传说能看见不能时空人事物的时刻）三叶与泷相遇，并在对方手上留下信号约定醒来后不忘记（当然还是忘记了）。黄昏过去，三叶与泷分别回到三年前与三年后的世界，真正的三叶回小镇拯救镇民（这里略过具体拯救过程）。结果当然是彗星来临，小镇居民都没死。回到现实的两人都忘了对方，只不过隐约觉得自己一直在寻找什么人。一直到两人都长大开始工作。……在某个东京早晨，相对开过的电车上的两人相遇，一眼就确定对方是自己一直寻找的人，于是奔出电车寻找。在一个阶梯前见到对方，但是不知道怎么开口，于是只能低头擦肩而过，但是泷还是在走过去之后回身喊住三叶问她:我是不是在哪里见过你。三叶回头，笑着流泪回答:我也是。
到此，电影结束。这两句对白是电影的最后台词。男女主最后在现实相遇。
我是不是在哪里见过你？
我也是！

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完美